经过与一十一（神木隆之介 饰）的恶战，濑文焚流（加濑亮 饰）身受重伤，命几不保。在此时期，青池里子（栗山千明 饰）随女儿小润（森山树 饰）悄然分开医院；而各国政要的一次关于复杂方案的秘密会议上，自称卑弥呼的日本代表抹杀一切人，代表SPEC持有者正式向普通人类宣战。世态险峻的当下，濑文急急出院，和当麻纱绫（户田惠梨香 饰）一同调查青池母女的行迹。而野野村组长（龙雷太 饰）则独自举动，查找复杂方案病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替退场，严酷的屠戮却从未中止。关于先人类的秘密昭然若揭，惨烈浩荡的人种战争行将拉开序幕……本片为SPEC系列完毕篇的前篇。
