成功解除潘达瓦战争危机后，海港城告别耐久安静再度堕入惊天危机全城突发连环爆炸案，携带大规模杀伤性武器电磁脉冲（EMP）炸弹密钥的委员长也在高速公路上被微妙劫持。东区分局明星警探吴英雄（赵又廷 饰）回击未果遭遇改装直升机扫射身陷险境，坠落高架桥千钧一发之际，东区分局警官陈真（林更新 饰）及时现身陷害吴英雄。 海港城危机不时，跨海大桥被炸毁，通往本岛独一路途隔绝，同时，一盘微妙录像带被寄往政府部门，包括徐达夫在内的多名通缉要犯在镜头里誓死自白：树立全新海港城，一切牺牲都是值得庆贺的。对此，政府宣布：“事关平安紧急事情，优先等级五。”就在全港备战微妙罪恶力气之时，大爆炸席卷全城，并构成电力中缀。整座城市堕入一片黑暗，连南区分局也被炸成废墟。 危殆时辰，吴英雄同陈真组成全新同伴，并偶遇被绑成人肉炸弹、高速驾驶直冲隧道的徐达夫（黄渤 饰）。三人乱作一团之时，却突然遇到从隧道口直冲而下的无人飞行器及雇佣军攻击。九死终身之后，吴英雄和陈真才得知徐达夫怀有身孕的老婆已被恐惧分子挟持，并将她的身体作为生物武器“伊鲁康吉”实验田。在三人身后，而更有骇人阴谋掩盖海港城，微妙暗杀组织——夜行者启动旨在24小时内屠城的“枯草方案”。海港城倾覆之际，“真英雄”组合及徐达夫组成“正义三人组”毛遂自荐，正与邪、黑暗与黑暗的终极对决再度来临……
